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MicroRNA课题设计策略

2021-07-26

    涉及miRNA的研究主要是建立miRNA、作用靶点和生物学功能之间的关系,三者都可作为切入点展开研究,本次我们介绍从目标miRNA开始的常用研究策略。(1)寻找目的miRNA① miRNA qRT-PCR检测    在病理组织、血液等样本中准确检测候选miRNA的表达谱,可有助于分析miRNA与疾病等条件的相关性,用于开发miRNA作为生物标志物;进一步,也可以寻找miRNA变化影响的靶基因表达变化。② miRNA表达芯片谱检测    MicroRNA芯片检测服务是检测样本总RNA中miRNA表达谱,筛选出差异表达共表达的miRNA。(2)预测靶基因以及靶基因功能    MicroRNA与靶基因的相互作用可以通过targetscan(http://www.targetscan.org/)、miRDB(http://mirdb.org/miRDB/)、miRWalk(http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/)等数据库进行预测。不同的数据库的计算方法存在差异,可以结合多个数据库的结果进行预测。预测到下游靶基因后,可以结合DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)进一步了这些基因所涉及的功能以及信号通路。(3)确定靶关系以及miRNA功能    体外实验中,利用qRT-PCR、荧光素酶报告质粒、RIP-Seq等方法,在改变miRNA丰度的情况下验证所预测的靶基因,确定其是否为miRNA的真实靶点;观察细胞表型变化,例如增殖、凋亡、侵袭转移等,和基因的表达分析相结合。    进一步,通过体内实验,构建功能获得(gain of function,GOF)和功能失活(loss of function,LOF)动物模型,利用miRNA agomir或者miRNA antagomir等调节动物体miRNA表达水平,从而验证其作用机制。    研究也可以从感兴趣的基因出发,寻找确定以该基因为靶向的miRNA,最后判断其功能;也同时,也可以将特殊的功能或者表型作为切入点,进而筛选引起这些变化的miRNA或者基因,最后寻找引起这些变化的基因或者miRNA。无论选择哪个切入点,研究最终的目的都是要阐明miRNA-靶基因-功能三者之间的关系。

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2022年度浙江省自然科学基金-北京中卫生物科研转化研究中心联合基金申请工作已经全面启动

2021-06-22

  根据《浙江省科学技术厅 浙江省自然科学基金委员会关于开展2022年度浙江省基础公益研究专项申报工作的通知》(以下简称《通知》),2022年度浙江省自然科学基金-北京中卫生物科研转化研究中心联合基金(以下简称省基金-北京中卫联合基金)的申请工作已经全面启动,现将注意事项和主要工作安排通知如下:一、区域创新发展联合基金介绍    为深化完善基础研究多元化投入机制,浙江省自然科学基金与浙江省药学会、中国电建集团华东勘测设计研究院有限公司、北京中卫生物科研转化研究中心、台州市政府、衢州市政府、浙江省水利厅设立浙江省自然科学基金联合基金。二、省基金-北京中卫联合基金资助方向2.1 重点项目资助方向-人口与健康领域   (1)胃癌卵巢转移的机制研究(申请代码选择H16的下属代码)针对胃癌卵巢转移关键机制仍不明确,治疗效果及预后差等问题,利用单细胞测序、模式动物模型等技术手段,开展胃癌卵巢转移关键基因及可能机制研究,寻找基于肿瘤调控的干预靶点,同时通过临床样本验证。实现胃癌卵巢转移发生发展机制关键科学问题的突破。   (2)蕈样霉菌病(皮肤淋巴瘤)发生发展相关机制研究(申请代码选择H16的下属代码)围绕蕈样霉菌病独特的病程发展规律与生物学行为,围绕其肿瘤微环境、免疫细胞调节等领域开展机制研究,寻找肿瘤调控的干预途径,实现对蕈样霉菌病发生发展机制关键科学问题的突破。   (3)基于微量金属离子基体系的腱-骨愈合机制研究(申请代码选择H18的下属代码)基于微量金属离子的梯度变化,促进肩袖组织梯度重建和一体化再生的关键技术研究,并基于此技术构建有临床应用前景微量金属离子基体系。申报人员及单位基本要求:    方向(1)(2)对全省依托单位开放,申报单位须与省内省级以下医疗卫生机构(不含省级,下同)合作申报(省级以下医疗卫生机构牵头申报的除外),且省内省级以下医疗机构人员须为项目主要参与人(排名前三,含项目负责人);方向(3)对省内省级以下医疗卫生机构(须为省基金依托单位,不包含省级医疗卫生单位,以浙江省卫生健康委员会网站https://wsjkw.zj.gov.cn/为准)开放;具有临床工作经验的申请人(需在申请书正文“工作基础”部分做出文字声明)同等条件下优先资助。2.2 探索项目资助方向-人口与健康领域  (1)具有地区特色的浙派中医传统理论和技术的机制探索研究(申请代码选择H27的下属代码)围绕温病学派和针灸学派的传统医学理论、蜂疗等传统医学技术在新环境下的开拓创新,特别是针对自体免疫类疾病(如溃疡性结肠炎)、老年退行性疾病(骨关节炎等)的应用创新和机制探索。  (2)具有地区特色的畲族医药传统理论及药材相关的机制探索研究(申请代码选择H27或H28的下属代码)围绕畲族医药的道地药材、传统理论及验方在新环境下的开拓创新,特别是针对肿瘤、自体免疫性疾病、肝脏疾病的应用创新和机制探索。   (3)自愈合可注射水凝胶技术在骨科领域应用的作用与机制探索研究(申请代码选择H18的下属代码)针对骨科常见的缺损修复应用场景,设计自愈合、低毒性或无毒性、可注射、可诱导成骨的水凝胶材料,并对其体内作用效果及机制进行探究。   (4)肠缺血再灌注中肠道屏障损伤及药物保护机制研究(申请代码选择H03的下属代码)围绕肠缺血再灌注过程中氧化应激、细胞凋亡过程,探索其发生发展机制以及药物作用靶点和保护机制,寻找药物治疗的干预途径。   (5)胆管炎肝脏损伤发生机制及治疗策略研究(申请代码选择H03的下属代码)针对临床急性重症胆管炎常伴随的肝脏损伤情况,探索肝脏损伤发生发展机制,探索调控通路及关键靶点,寻找治疗新途径。   (6)基于生物医用高分子材料的诊疗体系构建研究(申请代码选择H18的下属代码)利用仿生层状组装技术、生物功能化纳米材料等技术,围绕损伤修复、疾病靶向诊疗等临床问题,重点探究基于功能导向的高分子材料设计、性能调控、作用机制的应用基础科学问题。   (7)临床标志物高精度检测研究(申请代码选择H18或H20的下属代码)围绕肿瘤、心血管疾病等精准诊治需求,寻找特异性标志物并建立灵敏度高、特异性强的快速检测方法为精准医学提供技术支撑。申请人员及单位基本要求    方向(1)(2)(3)对全省依托单位开放,申请单位须与省内省级以下医疗卫生机构合作申报(省内省级以下医疗卫生机构牵头申报的除外),且省内省级以下医疗卫生机构人员须为项目主要参与人(排名前三,含项目负责人);方向(4)(5)(6)(7)对省内省级以下医疗卫生机构(须为省基金依托单位,不包含省级医疗卫生单位,以浙江省卫生健康委员会网站https://wsjkw.zj.gov.cn/为准)开放。具有临床工作经验的申请人(需在申请书正文“工作基础”部分做出文字声明)同等条件下优先资助。 三、申报方式和时间安排   (一)网络申报。2022年度基础公益研究专项采用网络在线填报方式,申请人请通过浙江省政务服务网进行网络申报(网址:www.zjzwfw.gov.cn/zjservice/item/detail/index.do?impleCode=ff8080815d551320015d58a5a2f200222331001216001&webId=1),点击“在线办理”,用政务服务网账号登录申报项目。申报须知请参看http://zjnsf.kjt.zj.gov.cn/portal/detail.html?typeid=2018915&postid=852859257396133888。   (二)审核推荐。各依托单位应做好项目申报的服务指导,并对项目进行审核,在规定时间内做好组织申报和审核上报工作。各高校附属医院统一由归口高校审核。      (三)填报时间。本次网上申报从2021年7月6日开始,申报和审核推荐截止时间分别为7月25日、7月30日,请申请人和依托单位妥善安排申报和审核时间。 四、咨询方式   北京中卫生物科研转化研究中心:王老师,0571-85333229

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